Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Romo1P60603 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Romo1P60603 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms