Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm2aP59997 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm2aP59997 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm2aP59997 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm2aP59997 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms