Protein–RNA interactions for Protein: P59900

Emilin3, EMILIN-3, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin3P59900 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emilin3P59900 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emilin3P59900 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emilin3P59900 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emilin3P59900 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Emilin3P59900 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Emilin3P59900 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Emilin3P59900 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Emilin3P59900 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Emilin3P59900 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emilin3P59900 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emilin3P59900 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emilin3P59900 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emilin3P59900 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emilin3P59900 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emilin3P59900 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Emilin3P59900 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms