Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdl3P58873 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdl3P58873 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdl3P58873 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdl3P58873 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdl3P58873 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdl3P58873 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rhbdl3P58873 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rhbdl3P58873 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rhbdl3P58873 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms