Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms