Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samsn1P57725 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samsn1P57725 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samsn1P57725 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms