Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMP3P54852 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMP3P54852 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMP3P54852 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMP3P54852 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMP3P54852 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMP3P54852 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMP3P54852 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMP3P54852 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMP3P54852 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMP3P54852 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMP3P54852 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMP3P54852 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMP3P54852 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMP3P54852 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMP3P54852 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMP3P54852 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMP3P54852 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms