Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ercc3P49135 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc3P49135 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc3P49135 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc3P49135 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms