Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC10P48553 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC10P48553 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC10P48553 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC10P48553 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms