Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkn1bP46414 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkn1bP46414 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn1bP46414 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms