Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf1P46099 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klf1P46099 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf1P46099 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf1P46099 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf1P46099 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms