Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSFMP43897 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSFMP43897 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSFMP43897 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSFMP43897 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSFMP43897 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSFMP43897 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSFMP43897 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSFMP43897 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSFMP43897 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSFMP43897 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSFMP43897 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSFMP43897 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSFMP43897 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSFMP43897 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3181.8 ms