Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msh2P43247 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msh2P43247 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msh2P43247 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msh2P43247 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msh2P43247 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msh2P43247 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msh2P43247 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Msh2P43247 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Msh2P43247 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh2P43247 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh2P43247 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh2P43247 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msh2P43247 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msh2P43247 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msh2P43247 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Msh2P43247 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh2P43247 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh2P43247 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Msh2P43247 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh2P43247 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msh2P43247 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms