Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTHFRP42898 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTHFRP42898 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTHFRP42898 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms