Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA3P42263 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA3P42263 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA3P42263 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms