Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TfamP40630 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TfamP40630 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TfamP40630 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TfamP40630 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TfamP40630 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TfamP40630 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TfamP40630 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TfamP40630 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TfamP40630 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TfamP40630 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TfamP40630 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TfamP40630 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TfamP40630 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TfamP40630 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TfamP40630 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TfamP40630 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TfamP40630 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TfamP40630 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TfamP40630 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TfamP40630 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TfamP40630 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TfamP40630 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TfamP40630 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TfamP40630 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TfamP40630 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TfamP40630 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TfamP40630 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TfamP40630 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TfamP40630 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TfamP40630 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TfamP40630 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TfamP40630 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TfamP40630 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TfamP40630 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms