Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acvr1P37172 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acvr1P37172 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acvr1P37172 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms