Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT2P35908 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT2P35908 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT2P35908 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT2P35908 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT2P35908 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT2P35908 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT2P35908 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT2P35908 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT2P35908 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT2P35908 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT2P35908 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT2P35908 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT2P35908 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT2P35908 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT2P35908 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT2P35908 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT2P35908 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT2P35908 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT2P35908 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT2P35908 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT2P35908 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT2P35908 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT2P35908 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT2P35908 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT2P35908 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT2P35908 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT2P35908 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT2P35908 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms