Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SsbP32067 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SsbP32067 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SsbP32067 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SsbP32067 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SsbP32067 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SsbP32067 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SsbP32067 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SsbP32067 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SsbP32067 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SsbP32067 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SsbP32067 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SsbP32067 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SsbP32067 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SsbP32067 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SsbP32067 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SsbP32067 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SsbP32067 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SsbP32067 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SsbP32067 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SsbP32067 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SsbP32067 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SsbP32067 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SsbP32067 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SsbP32067 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SsbP32067 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SsbP32067 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SsbP32067 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SsbP32067 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SsbP32067 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SsbP32067 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SsbP32067 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms