Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA6P31267 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA6P31267 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA6P31267 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms