Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnd1P30999 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnd1P30999 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms