Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Casp1P29452 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp1P29452 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp1P29452 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Casp1P29452 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Casp1P29452 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp1P29452 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp1P29452 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casp1P29452 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Casp1P29452 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casp1P29452 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms