Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IppP28575 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IppP28575 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IppP28575 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IppP28575 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IppP28575 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IppP28575 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IppP28575 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IppP28575 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IppP28575 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IppP28575 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IppP28575 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IppP28575 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IppP28575 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IppP28575 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IppP28575 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IppP28575 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IppP28575 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IppP28575 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IppP28575 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IppP28575 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IppP28575 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IppP28575 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IppP28575 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IppP28575 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IppP28575 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IppP28575 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IppP28575 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IppP28575 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IppP28575 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IppP28575 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IppP28575 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IppP28575 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IppP28575 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IppP28575 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IppP28575 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IppP28575 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IppP28575 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IppP28575 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IppP28575 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IppP28575 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IppP28575 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IppP28575 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IppP28575 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
IppP28575 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IppP28575 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IppP28575 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IppP28575 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IppP28575 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IppP28575 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IppP28575 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IppP28575 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IppP28575 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IppP28575 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms