Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMA1P25786 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA1P25786 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.8 ms