Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cdk11bP24788 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cdk11bP24788 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cdk11bP24788 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cdk11bP24788 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1608.6 ms