Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F2P24468 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F2P24468 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F2P24468 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms