Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PparaP23204 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PparaP23204 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PparaP23204 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PparaP23204 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PparaP23204 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PparaP23204 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PparaP23204 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PparaP23204 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PparaP23204 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PparaP23204 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PparaP23204 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PparaP23204 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PparaP23204 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PparaP23204 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PparaP23204 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PparaP23204 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PparaP23204 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PparaP23204 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PparaP23204 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PparaP23204 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PparaP23204 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PparaP23204 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PparaP23204 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PparaP23204 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PparaP23204 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PparaP23204 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PparaP23204 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PparaP23204 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms