Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxb9P20615 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb9P20615 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxb9P20615 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms