Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NelfeP19426 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NelfeP19426 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NelfeP19426 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NelfeP19426 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NelfeP19426 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NelfeP19426 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NelfeP19426 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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