Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sptan1P16546 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sptan1P16546 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sptan1P16546 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms