Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCK1P16333 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCK1P16333 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCK1P16333 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCK1P16333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCK1P16333 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCK1P16333 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCK1P16333 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCK1P16333 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCK1P16333 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCK1P16333 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCK1P16333 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCK1P16333 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCK1P16333 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NCK1P16333 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms