Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB4P16144 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB4P16144 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGB4P16144 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB4P16144 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms