Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhoP15409 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhoP15409 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhoP15409 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhoP15409 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhoP15409 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhoP15409 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhoP15409 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhoP15409 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhoP15409 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhoP15409 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhoP15409 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhoP15409 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhoP15409 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RhoP15409 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RhoP15409 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhoP15409 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhoP15409 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhoP15409 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhoP15409 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhoP15409 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhoP15409 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RhoP15409 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhoP15409 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhoP15409 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhoP15409 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhoP15409 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhoP15409 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhoP15409 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhoP15409 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhoP15409 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhoP15409 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RhoP15409 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhoP15409 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhoP15409 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhoP15409 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhoP15409 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhoP15409 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhoP15409 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhoP15409 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhoP15409 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhoP15409 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhoP15409 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhoP15409 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RhoP15409 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RhoP15409 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RhoP15409 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RhoP15409 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhoP15409 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhoP15409 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhoP15409 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhoP15409 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhoP15409 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RhoP15409 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RhoP15409 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhoP15409 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms