Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh3P13705 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh3P13705 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh3P13705 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh3P13705 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh3P13705 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh3P13705 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh3P13705 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh3P13705 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh3P13705 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh3P13705 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms