Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd5P13379 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd5P13379 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd5P13379 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd5P13379 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd5P13379 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd5P13379 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms