Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn2P11672 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn2P11672 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms