Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARBP10826 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARBP10826 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARBP10826 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARBP10826 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARBP10826 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARBP10826 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARBP10826 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARBP10826 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARBP10826 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RARBP10826 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARBP10826 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARBP10826 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARBP10826 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARBP10826 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARBP10826 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARBP10826 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARBP10826 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARBP10826 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARBP10826 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARBP10826 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARBP10826 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARBP10826 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RARBP10826 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARBP10826 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms