Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prf1P10820 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prf1P10820 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prf1P10820 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prf1P10820 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prf1P10820 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prf1P10820 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prf1P10820 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prf1P10820 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prf1P10820 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prf1P10820 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prf1P10820 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prf1P10820 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prf1P10820 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prf1P10820 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms