Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GLI2P10070 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GLI2P10070 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GLI2P10070 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GLI2P10070 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GLI2P10070 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI2P10070 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GLI2P10070 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GLI2P10070 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GLI2P10070 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GLI2P10070 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GLI2P10070 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI2P10070 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GLI2P10070 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GLI2P10070 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
GLI2P10070 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GLI2P10070 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GLI2P10070 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GLI2P10070 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GLI2P10070 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GLI2P10070 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GLI2P10070 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
GLI2P10070 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
GLI2P10070 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
GLI2P10070 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI2P10070 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GLI2P10070 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI2P10070 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI2P10070 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI2P10070 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI2P10070 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI2P10070 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI2P10070 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI2P10070 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI2P10070 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI2P10070 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI2P10070 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI2P10070 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI2P10070 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GLI2P10070 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GLI2P10070 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GLI2P10070 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GLI2P10070 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
GLI2P10070 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GLI2P10070 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI2P10070 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GLI2P10070 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GLI2P10070 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GLI2P10070 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GLI2P10070 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
GLI2P10070 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GLI2P10070 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
GLI2P10070 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms