Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00271P0C7V0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00271P0C7V0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms