Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO3P0C6S8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO3P0C6S8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms