Protein–RNA interactions for Protein: P0C242

Ccno, Cyclin-O, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnoP0C242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcnoP0C242 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CcnoP0C242 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcnoP0C242 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms