Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP3P08254 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP3P08254 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP3P08254 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP3P08254 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP3P08254 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP3P08254 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP3P08254 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP3P08254 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP3P08254 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP3P08254 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP3P08254 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP3P08254 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP3P08254 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP3P08254 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP3P08254 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP3P08254 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP3P08254 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP3P08254 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP3P08254 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP3P08254 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP3P08254 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP3P08254 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP3P08254 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP3P08254 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP3P08254 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP3P08254 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP3P08254 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP3P08254 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms