Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOCP08134 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOCP08134 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOCP08134 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOCP08134 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOCP08134 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOCP08134 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOCP08134 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOCP08134 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOCP08134 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOCP08134 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOCP08134 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOCP08134 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOCP08134 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOCP08134 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOCP08134 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOCP08134 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOCP08134 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOCP08134 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOCP08134 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms