Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB1P08034 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB1P08034 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB1P08034 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB1P08034 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB1P08034 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB1P08034 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB1P08034 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB1P08034 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB1P08034 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB1P08034 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB1P08034 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB1P08034 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB1P08034 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB1P08034 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB1P08034 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB1P08034 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms