Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM2P07951 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPM2P07951 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TPM2P07951 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPM2P07951 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPM2P07951 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPM2P07951 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPM2P07951 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM2P07951 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM2P07951 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM2P07951 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM2P07951 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM2P07951 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPM2P07951 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPM2P07951 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TPM2P07951 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM2P07951 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM2P07951 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM2P07951 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM2P07951 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPM2P07951 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPM2P07951 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TPM2P07951 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TPM2P07951 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPM2P07951 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPM2P07951 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM2P07951 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM2P07951 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM2P07951 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPM2P07951 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPM2P07951 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPM2P07951 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPM2P07951 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms