Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lamc1P02468 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lamc1P02468 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc1P02468 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms