Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53P02340 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tp53P02340 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tp53P02340 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53P02340 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53P02340 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tp53P02340 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tp53P02340 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms