Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01787 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01787 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01787 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01787 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01787 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01787 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01787 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01787 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01787 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01787 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01787 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01787 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01787 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01787 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01787 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms