Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01678 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01678 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01678 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01678 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01678 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01678 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01678 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01678 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01678 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01678 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01678 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01678 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01678 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01678 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01678 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01678 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01678 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01678 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01678 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01678 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01678 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01678 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01678 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01678 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01678 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01678 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01678 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01678 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01678 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01678 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01678 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01678 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01678 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01678 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01678 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01678 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01678 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01678 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01678 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01678 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01678 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01678 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01678 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01678 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
P01678 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01678 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01678 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01678 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01678 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01678 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01678 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms